Самці виділяють у воду сперматозоїди, які через вступний сифон потрапляють у мантійну порожнину самки. Там і відбувається запліднення. Запліднені яйця розвиваються на зябрових пластинах і їх виходять личинки (глохідії). Личинки невдовзі через вивідний сифон потрапляють у воду.
Молюскам характерно лише статеве розмноження. Серед них є роздільностатеві види (двостулкові, головоногі) та гермафродити (черевоногі). Розмножуються молюски, відкладаючи запліднені яйця. Запліднення у них зовнішнє (у двостулкових) або внутрішнє (у черевоногих та головоногих).
Дихальна система представлена зябрами (ктенідіями). Особливості будови зябер варіюють у різних груп двостулкових. Первинножаберні (Protobranchia), що є найбільш примітивними двостулковими, мають пару типових ктенідії з зябровими пелюстками. У нитежаберних (Filibranchia) є ниткоподібні зябра.